Niektóre niszczarki, najczęściej te większe, wymagają zastosowania worków gdzie gromadzone są zniszczone dokumenty. Worki występują w paczkach zawierających różne ilości worków w zależności od modelu niszczarki, do którego są przeznaczone. Zamiast worków często w różnych modelach niszczarek można zastosować kartony wielokrotnego użytku.